Prevalencia y caracterización genotípica de cepas de Staphylococcus aureus resistente a meticilina aisladas en un hospital regional mexicano / Prevalence and genotypic characterization of methicillin-resistant strains of Staphylococcus aureus isolated in a Mexican regional hospital

Resumen Introducción: Staphylococcus aureus es uno de los patógenos con mayor prevalencia en el mundo, asociado a una alta tasa de mortalidad y un rápido desarrollo de resistencia a los antimicrobianos. A pesar de su patogenicidad, su seguimiento epidemiológico en México es escaso. Objetivo: Analizar la epidemiología molecular local y determinar el origen clonal de cepas resistentes a meticilina (RM) aisladas de pacientes internados en el Hospital Central "Dr. Ignacio Morones Prieto". Métodos: Se llevó a cabo un estudio prospectivo de corte transversal, de julio a diciembre de 2016. La caracterización de las cepas se realizó mediante genotipificación Spa, la determinación por RPC punto final de la frecuencia de genes de virulencia específicos y su antibiograma. Resultados: A partir de estos datos, se obtuvo que la prevalencia de S. aureus RM fue de 25,7%, destacando la presencia del tipo Spa t895 en 76% de las cepas resistentes y un patrón similar de susceptibilidad a antimicrobianos. Conclusión: Los resultados de este estudio indican que la prevalencia regional de SARM no se ha modificado en los últimos 10 años y proporcionan información valiosa del origen clonal y los factores de virulencia de las cepas de S. aureus aisladas en la región.

Abstract Background: Staphylococcus aureus is one of most prevalent pathogens in the world associated with a high mortality rate and a rapid development of resistance to antibiotics. Despite its pathogenicity, epidemiological monitoring in Mexico is scarce. Aim: To analyze the local molecular epidemiology and determine the clonal origin of methicillin-resistant (MR) strains isolated from patients admitted to Hospital "Dr. Ignacio Morones Prieto". Methods: A cross-sectional prospective study was carried out from July to December 2016. The characterization of the strains was carried out by Spa genotyping, frequency of specific virulence genes by PCR and antibiogram. Results: The prevalence of MRSA was 25.7%, highlighting the presence of the Spa type t895 in 76% of the resistant strains and a similar pattern of susceptibility to antibiotics. Conclusion: The results of this study indicate that the regional prevalence of MRSA has not changed in the last 10 years and provide valuable information on the clonal origin and the virulence factors of the strains of S. aureus isolated in the region.

Caracterización genotípica de Staphylococcus aureus resistente a la meticilina prevalente en hospitales de Pakistán / Genotypic characterization of prevalent methicillin resistant Staphylococcus aureus in Pakistani community hospitals / Caracterização de Staphylococcus aureus resistente à meticilina prevalecente em hospitais da comunidade no Paquistão

El gen de la proteína A se usó como marcador genético para la caracterización de aislados de Staphylococcus aureus resistentes a la meticilina (SAMR). De un total de 130 aislados de Staphylococcus aureus, 90 fueron identificados como SAMR y 81 de éstos se pudieron caracterizar por tipificación spa. Todos estos aislados fueron obtenidos de cinco Hospitales Nacionales de la Comunidad. Se utilizaron dos juegos diferentes de cebadores para amplificar la región-X del gen de la proteína A en las cepas de SAMR. Un conjunto de cebadores, spa-F/spa-R ha identificado tres tipos de repeticiones diferentes, a saber, 7 repeticiones (spa 2), 8 repeticiones (spa 3) y 10 repeticiones (spa 4) y otro conjunto de cebadores, spa-1113F/spa-1514R ha identificado 4 tipos de repeticiones diferentes, a saber, 6 repeticiones (spa 1), 15 repeticiones (spa 6), y 17 repeticiones (spa 7) y 19 repeticiones (spa 8). Se identificó la repetición 11 (spa 5) con ambos conjuntos de cebadores. Los tipos de SAMR esporádicos que portaban las repeticiones 6, 7, 10, 17 y 19 fueron poco prevalentes mientras que los SAMR epidémicos con 8, 11, y 15 repeticiones fueron más prevalentes y se los consideró involucrados en la transmisión entre los pacientes dentro de los diferentes hospitales. Este trabajo concluye que la técnica spa es lo suficientemente eficiente como para diferenciar las cepas epidémicas, esporádicas y aquéllas que se transforman lentamente de esporádicas a epidémicas.

Protein A gene was used as a genetic marker for the characterization of Pakistani methicillin resistant Staphylococcus aureus (MRSA) isolates. Out of a total of 130 Staphylococcus aureus isolates, 90 were identified as MRSA and of these 90 MRSA, 81 MRSA isolates were characterized by spa typing. All of these isolates were collected from five National Community Hospitals. Two different sets of primers were used to amplify the X-region of Protein A gene in MRSA strains. One set of primers i.e, spa-F/spa-R identified three types of different repeats viz., 7 repeats (spa 2), 8 repeats (spa 3) and 10 repeats (spa 4) and another set of primers i.e. spa-1113F/spa-1514R identified 4 types of different repeats viz., 6 repeats (spa 1), 15 repeats (spa 6), and 17 repeats (spa 7) and 19 repeats (spa 8). Repeat 11 (spa 5) was identified with both sets of primers. Sporadic MRSA types carrying 6, 7, 10, 17 and 19 repeats were less prevalent, while the epidemic MRSA with 8, 11 and 15 repeats were more prevalent and considered to be involved in transmission among the patients within different hospitals. Research work concludes that spa technique is efficient enough to differentiate spa strains carrying variations in general and those slowly transforming from sporadic to epidemic outbreak in particular.

O gene da proteína A foi usado como marcador genético para a caracterização de isolados de Staphylo­coccus aureus resistentes à meticilina (SAMR). De um total de 130 isolados de Staphylococcus aureus, 90 foram identificados como SAMR e 81 destes puderam se caracterizar por tipificação spa. Todos estes isolados foram obtidos de cinco Hospitais Nacionais da Comunidade. Utilizaram-se dois jogos diferentes de cevadores para amplificar a região-X do gene da proteína A nas cepas de SAMRUn conjunto de ce­vadores, spa-F/spa-R tem identificado três tipos de repetições diferentes, a saber, 7 repetições (spa 2), 8 repetições (spa 3) e 10 repetições (spa 4) e outro conjunto de cevadores, spa-1113F/spa-1514R tem identificado 4 tipos de repetições diferentes, a saber, 6 repetições (spa 1), 15 repetições (spa 6), e 17 repetições (spa 7) e 19 repetições (spa 8). Foi identificada a repetição 11 (spa 5) com ambos os conjuntos de cevadores. Os tipos de SAMR esporádicos que tinham as repetições 6, 7, 10, 17 e 19 foram pouco prevalecentes enquanto que os SAMR epidêmicos com 8, 11, e 15 repetições foram mais prevalecentes e são considerados envolvidos na transmissão entre os pacientes dentro dos diferentes hospitais. Este trabalho conclui que a técnica spa é o suficientemente eficiente como para diferenciar as cepas epidêmicas, esporádicas e aquelas que se transformam lentamente de esporádicas em epidêmicas.